Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab42Q0PD08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab42Q0PD08 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab42Q0PD08 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms