Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34,41■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34,39■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Vps8Q0P5W1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Vps8Q0P5W1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34,32■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34,31■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34,31■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Vps8Q0P5W1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34,26■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34,24■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Vps8Q0P5W1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34,19■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34,14■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Vps8Q0P5W1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Vps8Q0P5W1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34,07■■■■□ 3,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms