Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SobpQ0P5V2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SobpQ0P5V2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SobpQ0P5V2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SobpQ0P5V2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SobpQ0P5V2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms