Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700061G19RikQ08EE8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700061G19RikQ08EE8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700061G19RikQ08EE8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700061G19RikQ08EE8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
1700061G19RikQ08EE8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms