Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fbln1Q08879 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fbln1Q08879 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fbln1Q08879 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fbln1Q08879 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fbln1Q08879 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbln1Q08879 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbln1Q08879 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbln1Q08879 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fbln1Q08879 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbln1Q08879 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fbln1Q08879 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbln1Q08879 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fbln1Q08879 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms