Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HgfQ08048 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HgfQ08048 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HgfQ08048 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HgfQ08048 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HgfQ08048 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HgfQ08048 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HgfQ08048 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HgfQ08048 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HgfQ08048 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HgfQ08048 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HgfQ08048 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HgfQ08048 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HgfQ08048 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HgfQ08048 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HgfQ08048 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms