Protein–RNA interactions for Protein: Q06219

Nr4a2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a2Q06219 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr4a2Q06219 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a2Q06219 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a2Q06219 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr4a2Q06219 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr4a2Q06219 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr4a2Q06219 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr4a2Q06219 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr4a2Q06219 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms