Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc2Q05020 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoc2Q05020 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoc2Q05020 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms