Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk16Q04735 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk16Q04735 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk16Q04735 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk16Q04735 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk16Q04735 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms