Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarcad1Q04692 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcad1Q04692 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcad1Q04692 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarcad1Q04692 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms