Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msx2Q03358 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msx2Q03358 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msx2Q03358 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msx2Q03358 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msx2Q03358 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Msx2Q03358 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx2Q03358 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msx2Q03358 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms