Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp11Q02853 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp11Q02853 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp11Q02853 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mmp11Q02853 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp11Q02853 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp11Q02853 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp11Q02853 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp11Q02853 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp11Q02853 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp11Q02853 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp11Q02853 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp11Q02853 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms