Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Cacna1sQ02789 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cacna1sQ02789 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cacna1sQ02789 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Cacna1sQ02789 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cacna1sQ02789 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cacna1sQ02789 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cacna1sQ02789 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cacna1sQ02789 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cacna1sQ02789 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Cacna1sQ02789 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cacna1sQ02789 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cacna1sQ02789 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cacna1sQ02789 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cacna1sQ02789 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cacna1sQ02789 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cacna1sQ02789 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms