Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GscQ02591 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GscQ02591 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GscQ02591 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GscQ02591 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GscQ02591 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GscQ02591 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GscQ02591 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GscQ02591 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GscQ02591 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GscQ02591 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GscQ02591 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GscQ02591 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GscQ02591 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GscQ02591 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GscQ02591 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GscQ02591 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GscQ02591 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GscQ02591 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GscQ02591 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GscQ02591 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GscQ02591 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GscQ02591 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GscQ02591 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GscQ02591 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GscQ02591 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GscQ02591 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GscQ02591 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GscQ02591 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GscQ02591 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GscQ02591 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GscQ02591 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GscQ02591 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GscQ02591 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GscQ02591 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GscQ02591 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GscQ02591 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GscQ02591 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GscQ02591 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GscQ02591 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GscQ02591 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GscQ02591 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GscQ02591 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GscQ02591 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GscQ02591 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GscQ02591 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GscQ02591 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GscQ02591 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GscQ02591 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GscQ02591 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GscQ02591 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GscQ02591 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GscQ02591 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GscQ02591 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GscQ02591 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GscQ02591 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GscQ02591 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GscQ02591 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GscQ02591 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GscQ02591 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GscQ02591 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GscQ02591 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GscQ02591 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GscQ02591 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GscQ02591 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GscQ02591 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GscQ02591 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GscQ02591 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GscQ02591 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GscQ02591 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GscQ02591 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GscQ02591 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GscQ02591 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GscQ02591 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GscQ02591 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GscQ02591 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GscQ02591 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GscQ02591 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GscQ02591 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GscQ02591 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GscQ02591 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GscQ02591 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GscQ02591 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GscQ02591 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GscQ02591 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GscQ02591 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GscQ02591 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GscQ02591 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GscQ02591 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GscQ02591 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GscQ02591 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GscQ02591 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GscQ02591 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GscQ02591 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GscQ02591 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GscQ02591 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GscQ02591 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GscQ02591 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GscQ02591 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GscQ02591 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms