Protein–RNA interactions for Protein: Q02526

Zfp41, Zinc finger protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp41Q02526 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp41Q02526 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp41Q02526 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp41Q02526 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp41Q02526 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp41Q02526 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp41Q02526 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp41Q02526 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp41Q02526 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp41Q02526 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp41Q02526 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zfp41Q02526 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zfp41Q02526 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp41Q02526 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Zfp41Q02526 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Zfp41Q02526 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp41Q02526 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp41Q02526 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms