Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ank1Q02357 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ank1Q02357 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ank1Q02357 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ank1Q02357 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ank1Q02357 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ank1Q02357 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ank1Q02357 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ank1Q02357 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ank1Q02357 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ank1Q02357 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ank1Q02357 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ank1Q02357 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ank1Q02357 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms