Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HmgcrQ01237 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HmgcrQ01237 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HmgcrQ01237 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmgcrQ01237 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms