Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gja5Q01231 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gja5Q01231 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gja5Q01231 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gja5Q01231 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gja5Q01231 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gja5Q01231 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Gja5Q01231 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gja5Q01231 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gja5Q01231 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gja5Q01231 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gja5Q01231 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gja5Q01231 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gja5Q01231 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gja5Q01231 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms