Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col1a2Q01149 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col1a2Q01149 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col1a2Q01149 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col1a2Q01149 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Col1a2Q01149 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms