Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms