Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp4Q00724 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp4Q00724 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp4Q00724 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp4Q00724 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms