Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Il6stQ00560 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Il6stQ00560 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Il6stQ00560 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Il6stQ00560 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Il6stQ00560 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Il6stQ00560 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms