Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GabpaQ00422 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabpaQ00422 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GabpaQ00422 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabpaQ00422 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GabpaQ00422 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GabpaQ00422 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GabpaQ00422 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GabpaQ00422 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GabpaQ00422 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GabpaQ00422 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GabpaQ00422 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms