Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp9bP98195 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp9bP98195 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp9bP98195 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp9bP98195 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp9bP98195 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms