Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp7P97864 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp7P97864 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp7P97864 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp7P97864 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp7P97864 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp7P97864 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp7P97864 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp7P97864 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp7P97864 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Casp7P97864 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp7P97864 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp7P97864 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp7P97864 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp7P97864 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp7P97864 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp7P97864 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp7P97864 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casp7P97864 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms