Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Xrn1P97789 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Xrn1P97789 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Xrn1P97789 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Xrn1P97789 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Xrn1P97789 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Xrn1P97789 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Xrn1P97789 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Xrn1P97789 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Xrn1P97789 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Xrn1P97789 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Xrn1P97789 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Xrn1P97789 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Xrn1P97789 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Xrn1P97789 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Xrn1P97789 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Xrn1P97789 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Xrn1P97789 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Xrn1P97789 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Xrn1P97789 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Xrn1P97789 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Xrn1P97789 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Xrn1P97789 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Xrn1P97789 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.1 ms