Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2cP97760 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2cP97760 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2cP97760 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2cP97760 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms