Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad4P97471 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad4P97471 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad4P97471 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad4P97471 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad4P97471 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smad4P97471 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad4P97471 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad4P97471 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smad4P97471 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad4P97471 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad4P97471 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad4P97471 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad4P97471 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad4P97471 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms