Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npas2P97460 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npas2P97460 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npas2P97460 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npas2P97460 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npas2P97460 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Npas2P97460 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas2P97460 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Npas2P97460 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas2P97460 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npas2P97460 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npas2P97460 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npas2P97460 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas2P97460 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npas2P97460 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npas2P97460 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npas2P97460 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms