Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nbr1P97432 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nbr1P97432 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nbr1P97432 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nbr1P97432 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nbr1P97432 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nbr1P97432 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nbr1P97432 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms