Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Taf1bP97358 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Taf1bP97358 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Taf1bP97358 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Taf1bP97358 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Taf1bP97358 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms