Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec1P97353 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec1P97353 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec1P97353 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec1P97353 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec1P97353 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec1P97353 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec1P97353 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec1P97353 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec1P97353 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec1P97353 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec1P97353 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec1P97353 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec1P97353 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec1P97353 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec1P97353 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec1P97353 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec1P97353 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec1P97353 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec1P97353 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec1P97353 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec1P97353 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms