Protein–RNA interactions for Protein: P84751

Ig heavy chain Mem5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P84751 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P84751 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P84751 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P84751 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P84751 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P84751 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P84751 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P84751 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P84751 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P84751 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P84751 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P84751 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P84751 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P84751 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P84751 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P84751 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P84751 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P84751 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P84751 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P84751 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P84751 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P84751 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P84751 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P84751 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P84751 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P84751 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P84751 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P84751 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P84751 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P84751 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P84751 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P84751 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P84751 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P84751 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P84751 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P84751 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P84751 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P84751 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P84751 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P84751 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P84751 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P84751 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P84751 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P84751 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P84751 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P84751 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P84751 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P84751 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P84751 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P84751 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P84751 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P84751 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P84751 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P84751 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P84751 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P84751 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P84751 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P84751 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P84751 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P84751 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P84751 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P84751 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P84751 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P84751 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P84751 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P84751 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P84751 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P84751 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P84751 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P84751 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P84751 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P84751 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P84751 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P84751 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P84751 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P84751 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P84751 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P84751 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P84751 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P84751 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P84751 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P84751 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P84751 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P84751 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P84751 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P84751 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P84751 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P84751 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P84751 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P84751 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P84751 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P84751 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P84751 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P84751 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P84751 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P84751 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P84751 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P84751 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P84751 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P84751 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms