Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ElocP83940 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ElocP83940 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ElocP83940 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ElocP83940 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ElocP83940 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ElocP83940 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ElocP83940 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ElocP83940 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ElocP83940 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ElocP83940 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ElocP83940 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ElocP83940 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ElocP83940 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ElocP83940 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ElocP83940 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ElocP83940 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ElocP83940 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ElocP83940 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ElocP83940 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ElocP83940 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ElocP83940 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ElocP83940 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ElocP83940 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ElocP83940 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ElocP83940 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ElocP83940 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ElocP83940 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ElocP83940 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ElocP83940 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ElocP83940 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ElocP83940 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ElocP83940 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ElocP83940 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ElocP83940 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ElocP83940 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ElocP83940 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ElocP83940 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ElocP83940 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ElocP83940 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ElocP83940 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ElocP83940 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ElocP83940 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ElocP83940 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ElocP83940 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ElocP83940 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ElocP83940 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ElocP83940 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ElocP83940 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ElocP83940 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ElocP83940 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ElocP83940 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ElocP83940 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ElocP83940 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ElocP83940 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ElocP83940 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ElocP83940 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ElocP83940 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ElocP83940 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ElocP83940 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ElocP83940 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ElocP83940 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ElocP83940 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ElocP83940 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ElocP83940 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ElocP83940 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ElocP83940 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ElocP83940 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ElocP83940 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ElocP83940 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ElocP83940 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ElocP83940 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ElocP83940 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ElocP83940 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ElocP83940 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ElocP83940 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ElocP83940 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ElocP83940 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ElocP83940 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ElocP83940 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ElocP83940 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ElocP83940 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ElocP83940 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ElocP83940 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ElocP83940 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ElocP83940 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ElocP83940 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ElocP83940 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ElocP83940 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ElocP83940 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ElocP83940 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ElocP83940 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ElocP83940 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ElocP83940 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ElocP83940 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ElocP83940 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ElocP83940 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ElocP83940 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ElocP83940 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ElocP83940 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms