Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q6P79568 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q6P79568 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q6P79568 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms