Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufd1P70362 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufd1P70362 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufd1P70362 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufd1P70362 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufd1P70362 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ufd1P70362 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ufd1P70362 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufd1P70362 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufd1P70362 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms