Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gfi1P70338 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfi1P70338 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfi1P70338 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfi1P70338 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfi1P70338 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms