Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NficP70255 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NficP70255 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NficP70255 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NficP70255 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NficP70255 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NficP70255 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NficP70255 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NficP70255 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NficP70255 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NficP70255 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NficP70255 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NficP70255 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NficP70255 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NficP70255 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NficP70255 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NficP70255 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NficP70255 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NficP70255 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NficP70255 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NficP70255 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NficP70255 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NficP70255 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NficP70255 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NficP70255 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NficP70255 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NficP70255 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NficP70255 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NficP70255 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NficP70255 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NficP70255 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NficP70255 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NficP70255 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NficP70255 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NficP70255 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NficP70255 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NficP70255 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NficP70255 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NficP70255 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NficP70255 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NficP70255 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NficP70255 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NficP70255 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NficP70255 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NficP70255 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NficP70255 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NficP70255 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NficP70255 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NficP70255 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NficP70255 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NficP70255 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NficP70255 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NficP70255 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NficP70255 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NficP70255 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NficP70255 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NficP70255 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NficP70255 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NficP70255 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NficP70255 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NficP70255 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NficP70255 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NficP70255 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NficP70255 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NficP70255 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NficP70255 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NficP70255 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NficP70255 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NficP70255 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NficP70255 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NficP70255 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NficP70255 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NficP70255 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NficP70255 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NficP70255 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NficP70255 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NficP70255 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NficP70255 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NficP70255 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NficP70255 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NficP70255 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NficP70255 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NficP70255 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NficP70255 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NficP70255 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NficP70255 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NficP70255 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NficP70255 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NficP70255 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NficP70255 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NficP70255 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NficP70255 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NficP70255 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NficP70255 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NficP70255 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NficP70255 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NficP70255 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NficP70255 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NficP70255 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NficP70255 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms