Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SbdsP70122 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SbdsP70122 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SbdsP70122 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SbdsP70122 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SbdsP70122 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SbdsP70122 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SbdsP70122 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SbdsP70122 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SbdsP70122 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SbdsP70122 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SbdsP70122 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SbdsP70122 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SbdsP70122 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SbdsP70122 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SbdsP70122 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SbdsP70122 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms