Protein–RNA interactions for Protein: P63277

Amelx, Amelogenin, X isoform, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmelxP63277 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmelxP63277 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmelxP63277 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmelxP63277 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmelxP63277 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmelxP63277 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmelxP63277 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AmelxP63277 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmelxP63277 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmelxP63277 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmelxP63277 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmelxP63277 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmelxP63277 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmelxP63277 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmelxP63277 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmelxP63277 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmelxP63277 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmelxP63277 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AmelxP63277 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmelxP63277 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmelxP63277 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmelxP63277 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmelxP63277 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms