Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl23aP62751 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl23aP62751 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl23aP62751 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl23aP62751 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms