Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsc22d1P62500 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsc22d1P62500 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc22d1P62500 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc22d1P62500 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc22d1P62500 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms