Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps13P62301 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps13P62301 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps13P62301 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps13P62301 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps13P62301 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps13P62301 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps13P62301 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps13P62301 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps13P62301 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps13P62301 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps13P62301 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps13P62301 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps13P62301 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps13P62301 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps13P62301 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps13P62301 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps13P62301 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps13P62301 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps13P62301 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps13P62301 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps13P62301 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms