Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc1P62192 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc1P62192 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc1P62192 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psmc1P62192 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmc1P62192 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc1P62192 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc1P62192 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc1P62192 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.6 ms