Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actr1aP61164 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actr1aP61164 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actr1aP61164 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actr1aP61164 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actr1aP61164 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actr1aP61164 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actr1aP61164 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr1aP61164 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr1aP61164 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actr1aP61164 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actr1aP61164 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actr1aP61164 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr1aP61164 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr1aP61164 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr1aP61164 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr1aP61164 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms