Protein–RNA interactions for Protein: P60954

Nol4, Nucleolar protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol4P60954 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nol4P60954 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nol4P60954 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nol4P60954 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nol4P60954 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nol4P60954 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nol4P60954 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nol4P60954 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nol4P60954 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nol4P60954 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nol4P60954 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nol4P60954 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nol4P60954 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nol4P60954 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nol4P60954 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nol4P60954 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nol4P60954 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nol4P60954 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nol4P60954 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nol4P60954 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Nol4P60954 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nol4P60954 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nol4P60954 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nol4P60954 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nol4P60954 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nol4P60954 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nol4P60954 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nol4P60954 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nol4P60954 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nol4P60954 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms