Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppfia3P60469 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppfia3P60469 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppfia3P60469 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfia3P60469 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ppfia3P60469 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms