Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nphp4P59240 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nphp4P59240 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nphp4P59240 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nphp4P59240 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nphp4P59240 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nphp4P59240 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nphp4P59240 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nphp4P59240 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nphp4P59240 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nphp4P59240 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nphp4P59240 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nphp4P59240 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nphp4P59240 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nphp4P59240 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms