Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdrg1P59048 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdrg1P59048 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdrg1P59048 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdrg1P59048 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms