Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpm2P58774 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm2P58774 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm2P58774 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm2P58774 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpm2P58774 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms