Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn4P57780 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn4P57780 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn4P57780 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn4P57780 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn4P57780 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn4P57780 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn4P57780 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn4P57780 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Actn4P57780 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Actn4P57780 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Actn4P57780 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms